Especialitzada en Filosofia del Dret, Francesca Puigpelat ha desenvolupat la seva trajectòria professional en l'àmbit de la docència i la recerca. Des de 1991 és catedràtica de la Universitat Autònoma de Barcelona, on va exercir el càrrec de degana de la Facultat de Dret del 2002 al 2008.

Col·labora en diferents institucions i organismes relacionats amb la bioètica. És membre del Comitè Consultiu de Bioètica de Catalunya, del Grup Bioètica, Dret i Societat i de l'Observatori de Bioètica, de la Universitat de Barcelona.